タイムゾーンがUTCから戻らない

Debian sid上にて。時々アップデートの後時計がおかしなことになることはあったけど、大抵ntpdateすると元に戻っていた。しかし今回はちょっとケースが違うようだ。まずterminal上では問題なし。.zshenvとかにTZ設定してあるから。しかしGNOMEから起動するアプリなんかは全部だめ。結局一度/etc/localtimeを消してsymlink張ってみたら問題なかった。dpkg-reconfigure tzdataでも問題ないね。zoneinfoのファイル形式変わった?